Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Cldn16Q925N4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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