Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms