Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Dnajc28Q8VCE1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc28Q8VCE1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc28Q8VCE1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Dnajc28Q8VCE1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc28Q8VCE1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Dnajc28Q8VCE1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc28Q8VCE1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc28Q8VCE1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc28Q8VCE1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc28Q8VCE1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc28Q8VCE1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Dnajc28Q8VCE1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Dnajc28Q8VCE1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Dnajc28Q8VCE1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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