Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms