Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms