Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trpv3Q8K424 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trpv3Q8K424 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms