Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms