Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms