Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms