Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpcpd1Q8C0L9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms