Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp38Q8BW70 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp38Q8BW70 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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