Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pdcl3Q8BVF2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pdcl3Q8BVF2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms