Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms