Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ttc28Q80XJ3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ttc28Q80XJ3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ttc28Q80XJ3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ttc28Q80XJ3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ttc28Q80XJ3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ttc28Q80XJ3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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