Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms