Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmed3Q78IS1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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