Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms