Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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CltbQ6IRU5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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CltbQ6IRU5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CltbQ6IRU5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms