Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ParpbpQ6IRT3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ParpbpQ6IRT3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ParpbpQ6IRT3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ParpbpQ6IRT3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ParpbpQ6IRT3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ParpbpQ6IRT3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ParpbpQ6IRT3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ParpbpQ6IRT3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms