Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Irf4Q64287 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Irf4Q64287 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Irf4Q64287 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Irf4Q64287 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Irf4Q64287 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Irf4Q64287 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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