Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms