Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Grik1Q60934 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Grik1Q60934 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Grik1Q60934 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Grik1Q60934 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Grik1Q60934 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Grik1Q60934 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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