Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms