Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms