Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms