Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nr2f1Q60632 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms