Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Trappc1Q5NCF2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Trappc1Q5NCF2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Trappc1Q5NCF2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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