Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc47Q505F5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc47Q505F5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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