Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms