Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933416C03RikQ3V063 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4933416C03RikQ3V063 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4933416C03RikQ3V063 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4933416C03RikQ3V063 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4933416C03RikQ3V063 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms