Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Obox3Q3UT54 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Obox3Q3UT54 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Obox3Q3UT54 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Obox3Q3UT54 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms