Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms