Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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