Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec24aQ3U2P1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec24aQ3U2P1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec24aQ3U2P1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec24aQ3U2P1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec24aQ3U2P1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec24aQ3U2P1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec24aQ3U2P1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec24aQ3U2P1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec24aQ3U2P1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec24aQ3U2P1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms