Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Fndc4Q3TR08 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Fndc4Q3TR08 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Fndc4Q3TR08 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Fndc4Q3TR08 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Fndc4Q3TR08 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Fndc4Q3TR08 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Fndc4Q3TR08 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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