Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna5Q2MKA5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms