Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Specc1lQ2KN98 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Specc1lQ2KN98 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms