Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms