Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl1bQ0MW30 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl1bQ0MW30 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms