Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms