Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tff1Q08423 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tff1Q08423 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tff1Q08423 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tff1Q08423 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tff1Q08423 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tff1Q08423 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tff1Q08423 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tff1Q08423 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tff1Q08423 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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