Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms