Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms