Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr4Q03142 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr4Q03142 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr4Q03142 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr4Q03142 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr4Q03142 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr4Q03142 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr4Q03142 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr4Q03142 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr4Q03142 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr4Q03142 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr4Q03142 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr4Q03142 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr4Q03142 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr4Q03142 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms