Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hoxd1Q01822 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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