Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelpQ01102 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelpQ01102 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms