Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms