Protein–RNA interactions for Protein: P97873

Loxl1, Lysyl oxidase homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxl1P97873 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Loxl1P97873 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms