Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx2P80206 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms