Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cux2P70298 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux2P70298 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux2P70298 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms